宇宙移民与宇宙战争的历史—宇宙世纪终结后，时光飞逝，人们迎来新的历(lì )史Regild Century(R.C.)，并开始了繁荣与和平的生活。　　RC1014年，耸立大地连接地球和宇(yǔ )宙的轨道天梯Capital Tower(首都塔)，从宇宙中为人类带来作为地球能量之源的Photon Battery，故被视(shì )为是圣地。　　其守护组织Capital Guard候补生贝尔利(lì )·杰纳姆在初次(cì )飞行的时候遭到所属不(bú )明MS G-SELF的攻击。贝尔利使用维修检查用(yòng )MS与其交战并成功捕获。　　然而贝尔利对G-SELF的驾驶(shǐ )者，名为アイーダ・レイハントン的宇宙海贼少女产生了某种(zhǒng )感觉。　　不满(mǎn )足特定条件便不会启动的G-SELF对贝尔利产(chǎn )生(shēng )了某种反应。　　宇宙海贼和アイーダ的目的、被G-SELF选中的贝尔利的命运、令RC全体动摇的真相——这一切只不过是Reconguista的开始。